MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017777	CTT	2	6	35	40	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017777	TCT	2	6	44	49	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017777	CCT	2	6	53	58	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017777	T	7	7	66	72	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017777	CTTTT	2	10	77	86	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017777	CTTTT	2	10	89	98	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017777	TA	3	6	120	125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017777	A	7	7	146	152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017777	CT	3	6	158	163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017777	A	6	6	190	195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017777	CAC	2	6	1216	1221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017777	CAT	3	9	1222	1230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017777	TC	3	6	1251	1256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017777	N	934	934	1259	2192	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017777	CTT	2	6	2218	2223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017777	TCT	2	6	2227	2232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017777	CCT	2	6	2236	2241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017777	T	6	6	2244	2249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017777	T	6	6	2255	2260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017777	CTTTT	2	10	2265	2274	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017777	AAG	2	6	2301	2306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017777	A	7	7	2308	2314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017777	TAT	2	6	2322	2327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017777	TA	3	6	2332	2337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017777	TA	3	6	2347	2352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017777	A	6	6	2374	2379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017777	A	6	6	2417	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017777	TCTTAT	2	12	2452	2463	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017777	TTA	2	6	3024	3029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017777	CCT	2	6	3544	3549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017777	T	7	7	3552	3558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017777	T	7	7	3561	3567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017777	A	8	8	3593	3600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017777	ATT	2	6	3616	3621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017777	AC	3	6	3628	3633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017777	A	7	7	3649	3655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017777	CT	3	6	3669	3674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017777	CTAA	2	8	3687	3694	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.